- 自序
- [卷一] 祷告药皇誓疏
- [卷一] 温证论治
- [卷一] 人身一小天地论
- [卷一] 书方宜人共识说
- [卷二] 日讲杂记
- [卷二] 《金匮》上工治未病一节辩
- [卷二] 辨《金匮》之
- [卷二] 二阳之病发心脾解
- [卷二] 维脉为病论治
- [卷二] 张、刘、李、朱后，当以薛、张、吴、喻配为八大家论
- [卷二] 医宜博览论
- [卷二] 读《伤寒补天石》、《贯珠集》二书合记
- [卷二] 妊娠阴脉小弱论
- [卷二] 读书十则（有小序）
- [卷二] 读书须看反面
- [卷二] 读书须悟对面
- [卷二] 读书须识正旨
- [卷二] 读书必须汇参
- [卷二] 读书须立主见
- [卷二] 读书必须隅反
- [卷二] 读书须善比例
- [卷二] 读书须剔错处
- [卷二] 读书须汰衍说
- [卷二] 读书须辨讹字
- [卷三] 石芝医话
- [卷三] 管见刍言
- [卷三] 核骨踝胫辩
- [卷三] 烂喉丹痧论
- [卷三] 脏腑受盛辩
- [卷三] 大温中饮炙甘草汤合论
- [卷三] 论柴胡
- [卷三] 论犀角、升麻
- [卷三] 辨紫茸之伪
- [卷三] 辨郁金之误
- [卷三] 大豆黄卷辩
- [卷三] 瘟疫赘言
- [卷三] 合论丹溪景岳相火大意
- [卷三] 升降出入说
- [卷三] 寸口趺阳紧脉不同论
- [卷三] 中腑中脏辩
- [卷四] 人身一小天地亦有南北两极论
- [卷四] 命门脉诊辩
- [卷四] 治肝补脾论
- [卷四] 四维相代，阳气乃竭解
- [卷四] 膀胱者州都之官，津液藏焉，气化则能出矣解
- [卷四] 膀胱上口论
- [卷四] 五芩散解
- [卷四] 辨《素问》“浊气归心”之讹
- [卷四] 祖气论
- [卷四] 连珠
- [卷五] 痘毒藏脾经说
- [卷五] 痘出同时论
- [卷五] 痘由太阴转属阳明论
- [卷五] 题费建中《救偏琐言》
- [卷五] 回澜论
- [卷五] 葵菜预解痘毒说
- [卷五] 拟张令韶《伤寒直解》辨证歌
- [卷六] 三皇药王考
- [卷六] 《脉诀》正讹
- [卷六] 三焦论赘言
- [卷六] 认疫治疫要言
- [卷六] 趋庭杂记
- [卷六] 辨医书音义
- [卷六] 夏月忌枳说
- [卷六] 喜伤心恐胜喜解
- [卷六] 恐伤肾思胜恐解
- [卷六] 思伤脾怒胜思解
- [卷六] 怒伤肝悲胜怒解
- [卷六] 忧伤肺喜胜忧解
- [卷六] 百合病赘言
- [卷七] 辨脾胃升降
- [卷七] 气有余便是火解
- [卷七] 东垣景岳论相火辩
- [卷七] 古今元气不甚相远说
- [卷七] 四时皆有伤寒说
- [卷七] 幼科似惊非惊辩
- [卷七] 痘科伏毒急于闷症说
- [卷七] 司天运气赘言
- [卷七] 周身经络总诀（有小序）
- [卷八] 木郁达之论
- [卷八] 颐毒颐字辩
- [卷八] 方药等分解
- [卷八] 保护元阳说
- [卷八] 读《伤寒论》附记
- [卷八] 论白
- [卷八] 烂喉痧论
- [卷八] 烂喉丹痧治宜论
- [卷八] 痧疹今昔不同，治法亦异说
- [卷八] 辨《活人书》妇人伤寒之说
- [卷八] 摄生杂话
- [卷九] 四大家辩
- [卷九] 论《医宗必读》
- [卷九] 论读景岳书不可专得其温补之益
- [卷九] 考正古方权量说
- [卷九] 《生气通天论》病因章句辩
- [卷九] 申明三年中气候相乖化疫之说
- [卷十] 虚劳论
- [卷十] 读先祖保阴煎谨记
- [卷十] 六味地黄丸方解
- [卷十] 八味地黄丸方解
- [卷十] 司天运气征验
- [卷十一] 三焦说
- [卷十一] 命门说
- [卷十一] 阴阳常变论
- [卷十一] 中道说
- [卷十一] 三百九十七法考
